FABUŁA:
Akcja toczy się w alternatywnym świecie, bardzo podobnym do naszego, w roku 1914. Technologia jest analogiczna do istniejącej wówczas w świecie rzeczywistym, zatem brak komputerów czy internetu, choć istnieją np. pociągi i telefony.
Podstawową różnicą między dwoma światami jest istnienie alchemii, która jest formą nauki. Wszelkie wynalazki i postęp pochodzą właśnie z tej dziedziny. Wymaga ona dużej wiedzy i zdolności. Jak każda nauka i alchemia rządzi się swoimi prawami, podstawowym jest zasada Równa Wymiana: aby coś uzyskać, należy w zamian poświęcić coś o tej samej wartości. Alchemia wykorzystywana jest zarówno w dobrych celach, takich jak tworzenie i ratowanie, jak i złych - niszczenie i zabijanie. Dlatego istnieją specjalne jednostki wojskowe, w których szkoleni i zatrudniani są wyselekcjonowani najlepsi alchemicy, których podstawowym zadaniem stało się wspomaganie żołnierzy podczas konfliktów zbrojnych. Nazywani są oni państwowymi alchemikami, z racji swych unikatowych umiejętności każdy z nich już na początku swej kariery otrzymuje stopień równy stopniowi majora.
Głowni bohaterowie to bracia Edward Elric i Alphonse Elric, mieszkający sami z matką Trishą, ponieważ ojciec, Hohenheim – poważany alchemik – opuścił ich, gdy byli mali. Jako początkujący alchemicy odnosili pewne sukcesy w alchemii. Pewnego dnia ich matka zachorowała, a niedługo potem zmarła. Transmutacja ludzi była niezbadaną, niebezpieczną dziedziną alchemii i była surowo zakazana przez prawo. Mimo to, Edward i Alphonse zdecydowali się na podjęcie ryzyka i przywołanie matki do życia.
Wynik ich działania okazał się tragiczny dla obu braci, mających wówczas 11 i 10 lat. Transmutacja zakończyła się porażką. Bracia otworzyli tzw. Bramę - twór widziany tylko przez tych, których dotyczyła ekstremalna wymiana; interpretowana jako wrota śmierci - która w myśl zasady równej wymiany zabrała lewą nogę Edwarda, a Alphonsa wciągnęła w całości w siebie. Edward chcąc ratować Alphonsa, w ostatniej chwili poświęcił swoją prawą rękę, aby zatrzymać duszę brata - udało mu się ją osadzić w starej zbroi stojącej nieopodal kręgu, który nakreślili.
Zaklęty w zbroję Alphonse uratował brata niosąc go do domu przyjaciółki Winry Rockbell, która wraz z babcią Pinako specjalizowała się w tworzeniu automatycznych zbroi – mechanicznych protez utraconych kończyn. Z powodu otrzymanych kończyn Ed otrzymał później przydomek Stalowego Alchemika (jap. Hagane no Renkinjutsushi. Ed postanowił naprawić swój błąd i przywrócić ciało brata. W dalszym ciągu upatrywał swoją szansę w alchemii, dlatego też postanowił zaciągnąć się do wojska i pracować dla niego na kontrowersyjnym stanowisku państwowego alchemika, aby mieć swobodny dostęp do zbiorów biblioteki wojskowej.
Podczas swoich wędrówek po Ishvarze i Liorze Edward i Alphonse natrafiają na trop Kamienia filozoficznego, substancji pozwalającej na ominięcie podstawowego prawa równej wymiany (brak potrzeby dania czegoś w zamian). Odkrywają jednak, że nie zawsze dostaje się to, czego się pragnie.

Główni bohaterowie:
Edward Elric - Stalowy alchemik jest głównym bohaterem. Ma 15 lat. Posiada protezy prawej ręki oraz lewej nogi (tzw. zbroje automatyczne)ponieważ stracił swoje kończyny po nieudanej transmutacji matki. Gwałtownie reaguje na uwagi na temat swojego niskiego wzrostu. Jego przydomek jest przypisywany czasami Alphonsowi, z powodu jego zbroi, o co również się wścieka. Zasłynął jako najmłodszy Państwowy Alchemik w historii Amestris bowiem został nim mając 12 lat. Mimo gwałtownego charakteru przejmuje się życiem zwykłych ludzi i stara się im pomóc. Kieruje się w życiu zasadą równowartej wymiany. Edward jest niski i szczupły, ale wysportowany i potrafi się bić, w czym nie przeszkadzają mu protezy. Jego ulubioną techniką walki jest transmutacja osłony prawej ręki w ostrze. Kiedy trzeba poważny, kiedy nie, normalny, wyluzowany chłopak. Szybko podejmuje decyzje, potrafi rozwiązać wiele zagadek oraz sprostać trudnym zadaniom. Ma złote oczy, blond włosy splecione w warkocz. Nienawidzi mleka i zastrzyków.
Alphonse Elric jest o rok młodszym bratem Edwarda. Jego dusza jest osadzona przez Eda w zbroi gdyż po nieudanej transmutacji matki stracił ciało. Mniej żywiołowy od swojego brata, jego zbroja jest często wykorzystana jako pojazd lub miejsce przechowania różnych osób lub rzeczy. Często musi uspokajać brata i przepraszać za jego zachowanie. Przez jakiś czas uważał, że Edward stworzył mu sztuczną pamięć. W mandze często zachowuje się dojrzalej od brata, podczas gdy w anime jest raczej potulny i naiwny.
Winry Rockbell jest przyjaciółką Eda i Ala z dzieciństwa. Miła, wesoła niebieskooka blondynka. Ponieważ jej rodzice, którzy byli lekarzami, zostali zabici na wojnie (w anime przez Roya Mustanga, w mandze przez Scara) mieszka sama z babcią Pinako. Jest świetnym mechanikiem i razem z babcią montuje automatyczne zbroje. Zrobiła taką np. dla Eda. Często jednak musi go naprawiać, gdy ten po raz kolejny uszkodzi swoje kończyny. Jej wiernym ,,przyjacielem" bez którego się nie rusza jest jej kochany klucz francuski którym Ed często obrywa, m.in. za zniszczenie protez. Martwi się o braci i jest zła, że o niczym jej nie mówią. W anime prowadzi z Sheską własne śledztwo w sprawie zabicia generała Hughesa przez homunkulusy.
Van Hohenheim (w anime - Świetlisty) jest ojcem Eda i Ala oraz znaną postacią świata alchemii. Zwykle pojawia się na krótko i zaraz znika w tajemniczych okolicznościach. Ed ma mu za złe, że zostawił ich jako dzieci oraz że nie uratował matki za pomocą alchemii. Jako pierwszy w historii uzyskał Kamień Filozoficzny. W anime dzięki kamieniowi on i jego pierwsza żona, Dante, przechodzą z jednego ciała w drugie, co sprawia, że są prawie nieśmiertelne. Niestety przenoszenie duszy z ciała w ciało okazuje się bardzo kosztowne dla obojga, dodatkowo nic nie można zaradzić na starzenie się duszy.
Roy Mustang - Płomienny Alchemik jest Państwowym Alchemikiem o stopniu pułkownika, później w anime awansuje na generała. Jego siła opiera się na żywiole ognia, którego zapłon stanowią iskry generowane za pomocą rękawiczek elektrostatycznych. Opiekuje się Edem i Alem, jest bardzo zaangażowany w ich sprawę, gdyż ma swoje własne, bliżej nieznane, cele. Oficjalnie pragnie zostać Generałem Armii po to, aby zmusić wszystkie kobiety w wojsku do noszenia minispódniczek. Według anime to on zabił rodziców Winry (czy raczej dokonał na nich egzekucji), ponieważ udzielali pomocy medycznej Ishvarczykom. W mandze uczynił to Scar. Mustang był uczniem ojca Rizy Hawkeye.
Alex Louis Armstrong - Silnoręki Alchemik jest Państwowym Alchemikiem w stopniu majora. Bardzo umięśniony, co lubi eksponować poprzez zdejmowania górnej części uniformu. Styl walki (nazywany często sztuką), przekazywany w rodzinie Armstrongów z pokolenia na pokolenie, jest połączeniem alchemii z siłą fizyczną . Jest jedną z zabawniejszych i wrażliwszych postaci, często pomaga braciom Elric. Próbuje nawet swatać swoją młodszą siostrę z Havokiem. W mandze posiada również starszą siostrę, która jednak nie pała do niego zbyt wielką miłością. Równać się z nim pod względem siły może tylko mąż Izumi Curtis, Shig.
Zolf J. Kimblee - Wybuchowy Alchemik w czasie wojny zabijał zarówno przyjaciół, jak i Ishvarczyków - dla przyjemności. Jego alchemia polega na detonowaniu substancji wybuchowych znajdujących się w ludzkim ciele, a więc używaniu ludzi jako bomb. To on ozdobił twarz Scara blizną i zabił jego brata.
Shou Tucker - Alchemik Życia jako pierwszy alchemik w historii stworzył chimerę mówiącą ludzkim głosem, za co otrzymał państwową licencję. Przez jakiś czas bracia Elric korzystali z jego biblioteki w poszukiwaniu sposobu na odyskanie ciał. Gdy zbliża się termin prezentowania wyników badań, Tucker tworzy kolejną chimerę. Ed i Al odkrywają, że jest to skrzyżowanie jego córeczki, Niny, z psem. W mandze zostaje zabity przez Scara, w anieme trafia do piątego laboratorium i staje się chimerą.
Tim Marcoh - Kryształowy Alchemik w czasie wojny pracował nad stworzeniem Kamienia Filozoficznego. Wystąpił z wojska i pracuje jako lekarz na wsi, ponieważ dręczą go wyrzuty sumienia za to co zrobił podczas wojny. Przekazuje jednak Edwardowi informacje o produkcji Kamienia.
Riza Hawkeye Niezastąpiona Pierwsza Pani Porucznik. Prawa ręka Pułkownika Mustanga, oraz jego najbliższa przyjaciółka. Wnuczka generała Grummana i córka nauczyciela Roya. "Miss Snajper", brała udział w wojnie w Ishvarze. Do akademii wojskowej przystąpiła w wieku 19 lat. Niejednokrotnie ratowała Mustangowi życie i wyciągała go z głupich sytuacji. Stoczyła walkę z Gluttonym i Lust i przyczyniła sie do jej zniszczenia. Została mianowana asystentką generała armii, Kinga Bradleya. Jest zamieszana z sprawę z Pride'em. Pomiędzy nią a Royem istnieje romantyczna relacja (silniej zaznaczona w mandze). Posiada psa - Black Hayate.
Maes Hughes służy w armii w stopniu podpułkownika. Dobry przyjaciel pułkownika Mustanga oraz braci Elric. Jeden z najlepszych dowódców w armii, do jego wad należy nieustanne wspominanie o córeczce Elicii oraz żonie Glacier (w mniejszym stopniu). Zostaje zabity przez homunkulusa Envy'ego podszywającego się pod podporucznik Marię Ross. Po swojej śmierci awansowany na Generała Brygady.
Izumi Curtis nauczycielka Eda i Ala, którym zastępuje poniekąd matkę, a zarazem wspaniały alchemik, który potrafi transmutować bez kręgu. Nie lubi Państwowych Alchemików i przede wszystkim w stosunku do nich pokazuje swą siłę i porywczość. Próbowała ożywić za pomocą alchemii swoje zmarłe dziecko, co kończy się otwarciem Bramy i utratą części narządów wewnętrznych, w tym macicy. W anime jej syn to homunkulus Wrath. Według anime Izumi jest leworęczna.
Scar, Ishbalczyk, którego prawdziwe imię nie jest znane, pseudonim nadano mu z powodu wielkiej blizny w kształcie "X" na twarzy. Pała nienawiścią do Państwowych Alchemików, którzy w czasie wojny wymordowali prawie cały jego naród. Od tamtej pory zabija Państwowych Alchemików. Do tego celu używa ręki otrzymanej od umierającego brata. Mimo że jest poszukiwany listem gończym, to z powodu szybkości (potrafi uchylić się nawet przed pędzącą kulą) nikomu nie udało się go do tej pory zabić. Zabija małżeństwo Rockbellów pomimo, że ci uratowali mu życie.
Pride (Pycha), w anime - King Bradley, ma Doskonałe Oko (a na nim znamię Uroborosa), którym wszystko widzi. W mandze jest to przybrany syn Bradleya, Selim, posiadający zdolność oddzielenia od siebie swego cienia, którego wysyła do walki zamiast siebie lub też sam zmienia się w swój cień (nie do końca wiadomo) Swoją tożsamość ujawnia przy spotkaniu z Rizą Hawkeye.
Greed (Chciwość) jest homunkulusem,który zbuntował się przeciwko Ojcu. Poszukuje informacji na temat przenoszenia duszy z jednego ciała w drugie. Potrafi zmienić swoją skórę w organiczny węgiel, który staje się niezwykle twardym pancerzem. Stoi na czele chimer powstałych głównie z byłych wojskowych. Znamię Uroborosa ma na lewej ręce. W anime zabija go Ed, natomiast w mandze zostaje pochwycony przez Wrath'a i zabity w kryjówce Ojca.
Lust (Nieczystość) jest homunkulusem. W anime jako człowiek była ukochaną brata Scara. Ma umiejętność zamienienia swoich paznokci w ostre wydłużające się szpikulce. Znamię Uroborosa na piersi. W anime postanawia pomóc Edowi, za co zostaje zamordowana (nie stawia jednak żadnych oporów gdyż stwierdza że zdała sobie sprawę z tego, iż chciała stać się człowiekiem tylko po to, by móc umrzeć) przez Wrath'a. W mandze niewiele różni się od swojego animowanego odpowiednika. Pozostaje jednak w pełni wierna swemu stwórcy. Zabija ją Roy Mustang.
Envy (Zazdrość) jest jednym z najokrutniejszych homunkulusów. W anime jest zmarłym na wskutek zatrucia rtęcią synem Hohenhaima i Dante. Potrafi zmieniać dowolnie swoją postać, co czyni go jednym z najpotężniejszych homunkulusów. Poza tym przejmuje on umiejętności osoby, w którą sie przekształcił Tatuaż z Uroborosem ma na lewym udzie.
Gluttony (Obżarstwo, Nieumiarkowanie w jedzeniu i piciu) jest homunkulusem o nieokiełznanym apetycie. Potrafi zjeść wszystko: od kamieni po tytan, choć żywi się głównie ludźmi. Traktuje Lust jak matkę, wraz z którą poszukuje Kamienia Filozoficznego. Znamię Uroborosa ma na języku.
Wrath(Gniew), w anime jest homunkulusem rozpaczliwie poszukującym kobiety, którą mógłby nazwać matką. Jako jedyny homunkulus może posługiwać się alchemią, co zawdzięcza prawemu ramieniu Eda, które ten ostatni stracił podczas transmutacji matki. Znamię Uroborosa ma na prawej stopie. Jest homunkulusem dziecka Izumi (które straciła przez chorobę podczas ciąży). W filmie kinowym przyczynia się do otworzenia bramy przez Ala, tym samym tam wracając.
Sloth (Lenistwo) jest w anime homunkulusem będącym błędem transmutacji matki Eda i Ala, gdzie potrafi zmienić swój stan ciała w ciecz. Pracuje w armii jako sekretarz Fuhrera. Nie pamięta swego poprzedniego życia, jednak troskliwie opiekuje się Wrathem jak własnym dzieckiem. Zabija ją Ed. Znamię Uroborosa ma na piersi.
Pinako Rockbell jest babcią Winry. Opiekuje się Winry, od kiedy ta została sierotą. W młodości nazywana "Panterą z Resembool". Stara znajoma Hohenheima.
Rose, tajemnicza postać z miasta Lior, podczas wojny porwana przez armię, po powrocie nie mogła wydobyć z siebie głosu i miała dziecko. W anime istnieje silna sugestia uczucia do Eda. Ślepo oddana "Wielebnemu" Cornellowi, który obiecał przywrócić do życia jej narzeczonego.
Sheska - nieco dziwna dziewczyna, czyta wszystkie książki, jakie się jej nasuną. Posiada wspaniałą pamięć - pamięta każde słowo z każdej książki, jaką przeczytała. Zatrudniona przez Hughesa w wojskowej księgowości po spaleniu części państwowej biblioteki.